1. 入选国家万人计划科技创新领军人才（2021.12）
2. 2021年度上海市生物信息学会杰出贡献奖（2021）
3. 格致论道科学传播大使（2021）
4. Journal of Genetics and Genomics （《遗传学报》）2020年度优秀编委奖（2020）
5. 英国皇家学会—牛顿高级访问学者（剑桥大学）（2019～2022）
6. 遗传与发育协同创新中心2019年度“十大科技进展”（2020）
7. 2019年度中国生物信息学十大进展（2020）
8. 2019年度中国生物信息学十大数据库（2020）
9. 入选科技部中青年科技创新领军人才（2018）
10. 中科院院长奖（导师）（2018）
11. 教育部自然科学一等奖（第5完成人）（2018）
12. 入选上海市优秀学术带头人计划（2016）
13. 入选“中国科学院特聘研究员” -- 特聘核心骨干（2015）
14. 中国科学院青年创新促进会（首届）“优秀会员”（2015）
15. 国家杰出青年科学基金 （2015）
16. 国家自然科学二等奖（第2完成人）（2015）
17. 中国科学院上海分院“青年五四奖章”（2015）
18. 上海市遗传学会杰出贡献奖（2015）
19. 中国科学院青年创新促进会2012-2013年度“优秀会员”（2013）
20. 入选国家“万人计划”第一批“青年拔尖人才”（2013）
21. 中科院青年科学家奖（2012）
22. 中科院上海生科院-美国礼来公司优秀毕业论文导师奖（2012）
23. 中科院上海分院第三届杰出青年科技人才奖（2012）
24. 教育部自然科学奖（一等）（第2完成人）（2012）
25. 上海市科技启明星（2011）
26. 全国百篇优秀博士学位论文（2011）
27. 入选首届中国科学院青年创新促进会（2011）
28. 复旦大学优秀博士学位论文（2010）
29. 上海市优秀博士学位论文（2009）
30. 法国赛诺菲-安万特-上海生科院青年人才奖（2009）
31. 日本明治乳业生命科学奖（2009）
32. 中国科学院卢嘉锡青年人才奖（2009）
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